Nifuroksazyd wykazuje działanie przeciwbakteryjne, skuteczne przeciwko większości bakterii wywołujących zakażenia jelitowe. Jest skuteczny przeciwko ziarniakom Gram-dodatnim (Staphylococcus, Streptococcus) i drobnoustrojom Gram-ujemnym (Salmonella, Shigella, Klebsiella, Escherichia), nie wpływa na bakterie z rodzaju Proteus, Pseudomonas, Providentia, nie zaburza równowagi mikrobiologicznej przewodu pokarmowego.